Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms