Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms