Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria1P23818 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria1P23818 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria1P23818 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms