Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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