Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms