Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkchP23298 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms