Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou3f1P21952 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms