Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmnb2P21619 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmnb2P21619 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms