Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcer1aP20489 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcer1aP20489 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Fcer1aP20489 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms