Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms