Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F3P20352 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F3P20352 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F3P20352 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F3P20352 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F3P20352 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
F3P20352 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F3P20352 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F3P20352 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F3P20352 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F3P20352 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F3P20352 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F3P20352 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F3P20352 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F3P20352 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F3P20352 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F3P20352 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F3P20352 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F3P20352 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms