Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms