Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P20040 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P20040 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P20040 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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