Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms