Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox5bP19536 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms