Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms