Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka3P18654 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms