Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms