Protein–RNA interactions for Protein: P18608

Hmgn1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn1P18608 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn1P18608 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms