Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18533 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18533 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18533 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18533 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18533 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18533 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18533 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18533 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18533 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18533 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18533 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18533 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms