Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms