Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd48P18181 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd48P18181 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cd48P18181 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd48P18181 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd48P18181 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd48P18181 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd48P18181 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd48P18181 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd48P18181 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd48P18181 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd48P18181 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd48P18181 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd48P18181 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cd48P18181 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd48P18181 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd48P18181 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd48P18181 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd48P18181 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd48P18181 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd48P18181 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd48P18181 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cd48P18181 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms