Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PcnaP17918 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PcnaP17918 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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