Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms