Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms