Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sptan1P16546 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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