Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf271P15620 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf271P15620 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf271P15620 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms