Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme1P15532 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms