Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kcnc1P15388 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms