Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-D1P14427 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms