Protein–RNA interactions for Protein: P13504

Il1r1, Interleukin-1 receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1r1P13504 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il1r1P13504 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms