Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms