Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx1P13297 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx1P13297 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms