Protein–RNA interactions for Protein: P12979

Myog, Myogenin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyogP12979 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyogP12979 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MyogP12979 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MyogP12979 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MyogP12979 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MyogP12979 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MyogP12979 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyogP12979 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyogP12979 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyogP12979 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyogP12979 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyogP12979 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyogP12979 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyogP12979 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyogP12979 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms