Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms