Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp1P12032 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp1P12032 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms