Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtcP11725 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtcP11725 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtcP11725 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtcP11725 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms