Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms