Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lire1P11260 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lire1P11260 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lire1P11260 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lire1P11260 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms