Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh3P10287 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms