Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CatspereP0DP43 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms