Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb2P0C1T1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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