Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf1P09925 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf1P09925 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms