Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnfP06804 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnfP06804 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnfP06804 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnfP06804 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TnfP06804 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TnfP06804 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TnfP06804 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnfP06804 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms