Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms