Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P04212 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P04212 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04212 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04212 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04212 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04212 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04212 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04212 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04212 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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