Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms