Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt10P02535 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt10P02535 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt10P02535 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms