Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01823 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01823 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01823 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01823 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01823 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms