Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01740 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01740 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01740 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01740 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01740 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01740 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01740 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01740 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01740 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01740 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01740 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01740 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01740 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01740 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01740 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01740 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01740 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01740 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01740 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01740 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01740 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01740 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01740 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01740 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01740 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01740 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms